Полиграф не является волшебным прибором, дающим ответы на поставленные вопросы. Это всего лишь инструмент, такой же, как молоток или скальпель. Если скальпель попадет в руки плохого врача, то он просто зарежет пациента, то же самое может произойти и с полиграфом, попавшим в руки неподготовленного или безответственного полиграфолога. 

Детектор-полиграф не определяет ложь как таковую. Детектор-полиграф всего лишь фиксирует реакцию организма на внешние раздражители (в случае с полиграфом внешними раздражителями являются задаваемые вопросы).

Почти любой человек испытывает естественное волнение при прохождении обследования (волнение не испытывают только те лица, для которых результат обследования не может оказать никакого влияния на последующую жизнь или работу ,то есть проводить обследование и пытаться выявить неправдивые ответы у хозяев предприятия, заказчиков обследования или просто любопытствующих абсолютно бессмысленно). Степень волнения индивидуальна и не может искажать конечный результат, так как он получается путем сравнения интенсивности и типа реакции на разные виды вопросов.

Полиграф нельзя обмануть, поскольку живой организм всегда реагирует на внешние раздражители, а фиксируемые параметры выбраны таким образом, чтобы максимально затруднить сознательный контроль.

В том случае, если обследуемый пытается контролировать свои реакции при ответах на вопросы, его реакции или усиливаются, или он перестает отвечать на задаваемые вопросы (в случае йогов, любителей «помедитировать» или прошедших «специальную подготовку»), что сразу фиксируется оператором и отражается в заключении. Полиграфу можно сопротивляться, игнорируя просьбу оператора о соблюдении неподвижности в процессе обследования или нарушив запрет на употребление медицинских или наркотических препаратов, а также алкоголя перед обследованием. 

Однако единственным результатом такого сопротивления будет заключение, в котором будет сказано, что «обследуемый оказал сознательное сопротивление при прохождении обследования» или «сознательно проигнорировал запрет на употребление вышеуказанных препаратов». 

1. Что может полиграф 

Полиграф действительно может: 

- зафиксировать систематическую повышенную реакцию на ключевой, односложно поставленный вопрос и обязанностью полиграфолога является выяснение причин данной реакции; 
- зафиксировать несистематическую реакцию на какую либо группу вопросов, в причинах которой надо разбираться в процессе послетестового собеседования; 
- определить нарушения в работе организма (отсутствие реакций на внешние раздражители), вызванные как сознательными действиями обследуемого (приемом наркотических или психотропных препаратов, несоблюдением инструкций оператора и т. д.), так и болезнью. 

2. Чего не может полиграф 

Полиграф не может:

- помочь в составлении психологического портрета личности; 
- помочь в выявлении особенностей нервной системы; 
- помочь в определении профессиональных качеств и навыков; 
- ответить на какой бы то ни было вопрос, связанный с мотивацией, стрессоустойчивостью или любой другой вопрос, связанный с психологией; 
- дать однозначный ответ на вопрос о самооценке эффективности работы сотрудника; 
- дать однозначный ответ на вопрос о наличии или отсутствии уважения к владельцу фирмы; - дать однозначный ответ на любой вопрос, касающийся абстрактных понятий. 

Утверждения, что с помощью полиграфа можно определять вышеуказанные параметры, равносильно утверждению, что мыло можно использовать в качестве смазочного материала в двигателе внутреннего сгорания. 

Такие утверждения делаются недобросовестными полиграфологами для придания полиграфу мифических возможностей и увеличения его значимости, однако они не имеют никакого отношения к действительности.